Działający w firmie Evatronix SA System Zarządzania Jakością oparty jest na procesowym modelu zarządzania. Procesy, zidentyfikowane w odniesieniu do przyjętych celów, zostały powiązane w spójny system określający ich sekwencję i wzajemne oddziaływanie.
Strategiczna decyzja ustanowienia Systemu Zarządzania Jakością została podjęta przez zarząd firmy Evatronix SA w 2000 roku. W roku 2001 przystąpiono do prac związanych z realizacją tego projektu. Od listopada 2002 roku system był wdrażany w kolejnych działach firmy. Od tej pory system jest na bieżąco dostosowywany i doskonalony w oparciu o wymagania obowiązującej normy, wyniki raportów z audytów oraz raporty z przeglądów systemu zarządzania.
Obecnie firma posiada certyfikat zgodności Systemu Zarządzania Jakością z normą PN-EN ISO 9001:2015, obejmujący sprzedaż i dostawę inżynierskich systemów i urządzeń wspomagających projektowanie oraz wytwarzanie w mechanice i elektronice.